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手机vcf是什么文件(手机vcf是什么文件)

手机vcf是windows系统中的outlook名片存储格式文件。VCF是一个C++编写的开源项目,全名为Visual Component Framework,中文名:可视化组件框架。VCF格式的通讯录格式现在被广泛使用。

知识分享,今天中国AI网小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于vcf是什么文件的问题,于是小编就整理了5个相关介绍vcf是什么文件的解答,让我们一起看看吧。

手机vcf是什么文件(手机vcf是什么文件)  第1张

文章目录:

一、手机vcf是什么文件

手机vcf是windows系统中的outlook名片存储格式文件。

VCF是一个C++编写的开源项目,全名为Visual Component Framework,中文名:可视化组件框架。

VCF格式的通讯录格式现在被广泛使用,一般诺基亚、摩托罗拉手机出口的通讯录格式都是VCF。 您可以在需要时将VCF格式保存到计算机中。

许多在线通讯录导入格式也是VCF。 例如,飞信已添加了导 ********* 系人的功能。 您可以将电话通讯录导入到Fetion的通讯录中,这样,无论手机在不在身边,都可以用电脑来访问自己的通讯录。

常见的vcf文件尤其是手机的vcf包含信息不多可以用记事本编辑。把文件拷贝到电脑,右键用记事本打开。

扩展资料:

VCF文件的基本结构

VCF文件是由2个重要部分组成的:

1、the variant call records

这一部分是VCF文件的主体部分,记录了每个样品每个位点处的基因分型信息。

2、the header

以‘##’为前缀,通常包含fileformat、fileDate、reference等信息,头行信息( header line )

参考资料来源:

百度百科-VCF

二、手机vcf是什么文件

手机vcf是文件是手机通讯录的备份文件,VCF格式是Windows系统中outlook的名片存储格式,打开VCF格式需要使用各手机的配套软件,用outlook也可以打开VCF文件

VCF格式通讯录格式现在用途广泛,一般手机导出通讯录的格式都为VCF。可以把VCF格式保存到电脑上以备不时之需。

扩展资料:

手机备份通讯录的其他方式:

1、SIM卡保存联系人

如果你能确保手机不丢,最稳妥的方式就是将联系人保存在SIM卡上,再怎么换手机也不怕联系人丢失。需要注意的是,现在很多新款手机在新建联系人时无法选择保存位置,默认都是手机本地,此时你就需要用到下面的几种方法了。

2、导出通讯录

以各品牌的Android手机为例,在联系人设置界面都能找到“导出联系人”的选项,点击它就能将手机通讯录以.vcf格式文件的形式保存在手机内置存储卡中,我们可以将vcf文件上传到常用的网盘中(或电脑本地),更换新机或新卡时将它下载到手机里,在联系人设置中选择导 ********* 系人即可。

3、APP备份联系人

早前QQ和微信内都集成有备份联系人的功能,但如今的新版本都已经取消了类似功能。在这里小编向大家推荐“QQ同步助手”,这款APP可以使用QQ或微信账号直接登录,可以将本地联系人上传到服务器端,并支持自动联系人备份功能和自动去重复功能。

4、手机厂商的云服务

如今几乎所有Android手机都预装各自品牌的云服务功能,在这里也可以将包括联系人、短信、通话记录、记事本、闹钟等信息同步到云端服务器,而且可以开启自动备份功能,随时保证云端数据的时效性。

参考资料来源:百度百科- VCF(通讯录导出的一种格式)

三、什么是VCF?

什么是VCF文件:全称“The variant call format”,变体调用格式,是一种用于存储DNA多态性数据如snp、插入、删除和结构变体和丰富注释的通用格式。

什么是VCFtools:VCFtools是一个软件套件,它实现了处理VCF文件的各种工具,包括验证、合并、比较,还提供了一个通用的Perl API。

VCF格式:由标题部分(header)和数据部分(Body)组成。标头包含任意数量的元信息行,每一行都以字符' ## '开头,用TAB键分隔开的字段定义行(field definition line)以单个' # '字符开头。元信息头行提供了数据部分中使用的标记和注释的标准化描述。

字段定义行(field definition line)强制有八个列,相应的数据列代表

染色体 chromosome (CHROM);

基于1的位置开始的变体 a 1-based position of the start of the variant (POS);

变体的惟一标识符 unique identifiers of the variant (ID);

参考等位基因 the reference allele(REF);

替代非引用等位基因的逗号分隔列表  a comma separated list of alternate non-reference alleles(ALT);

phred-scaled质量分数  a phred-scaled quality score(QUAL);

网站过滤信息site filtering information (FILTER);

一个额外的分号分隔的列表和用户可扩展的注释 a semicolon separated list of additional, user extensible annotation (INFO)。

GT,genotype,基因型,将等位基因编码为数字:0表示参考等位基因,1表示ALT列中列出的第一个等位基因,2表示ALT列中列出的第二个等位基因,以此类推。等位基因的数量表明样本的倍性,而分隔符表明相对于其他数据线,等位基因是阶段性的(' | ')还是非阶段性的(' / ')。

PS, phase set,表明具有相同PS值的基因型等位基因排列顺序相同。

DP,读取深度。

GL,genotype likelihoods,给定REF和ALT字段中定义的等位基因集,所有可能的基因型的基因型可能性。

GQ, genotype quality,在位点变异的情况下,基因型调用错误的概率。

四、VCF文件格式解析

VCF文件全称为Variant Call Format,表示基因组的变异信息,通常为GATK和Samtools软件处理所得到。
VCF文件大致可以分为两个部分:

头文件信息主要包括vcf文件版本、FORMAT、INFO、参考基因组以及执行程序等信息。
表头各列含义详解:

五、生物数据格式 - vcf/bcf

VCF是Variant Call Format的简称,该格式文件是专门用于存储基因序列突变信息的一种文本文件,包括单碱基突变SNV、单核苷酸多态性SNP、InDel、拷贝数变异CNV和结构变异SV等,文件可以采取editplus或pilotedit(建议)打开查看,其二进制存储格式是BCF。vcf文件后续可以用于多种分析,包括但不限于:进化树分析、群体结构分析、PCA分析、GWAS关联分析等。vcf文件格式如下:

VCF文件开头是整体的注释信息,以##作为起始,其后接FILTER、INFO、FORMAT等,其中##FILTER开头的行是vcf主体record中第七列缩写词的说明、##INFO开头的行注释vcf主体record中第8列的缩写字母、##FORMAT开头的行注释第九列的缩写字母。
在header之后,vcf主体的每一行是一条record,固定列有9列,以及在之后的第十列,它们分别是:
第一列:#CHROM,染色体号
第二列:POS,在染色体上的位置
第三列:ID,突变名称,一般只有人类才有dbSNP编号,以rs开头
第四列:REF,参考基因组碱基类型,必须大写
第五列:ALT,变异碱基类型,大写,多个以逗号分隔,‘.'表示缺失
第六列:QUAL,变异检测质量值,越高越可靠
第七列:FILTER,标记过滤结果的列:通过质控过滤标准的标记为‘PASS’,后续可用其他工具进行挑选过滤
第八列:INFO,附加信息列,附加信息的注释在header的##INFO中
第九列:FORMAT,后面信息的说明列
第十列开始为样品信息:GT=genotype、AD=碱基支持数量、DP=测序深度总和、PL=归一化后基因型的可能性、GQ=PL判读的基因型的质量值,其中当第二小的值小于99时,有必要怀疑基因型的可靠性。

vcf文件基本由bam文件生成,当得到排序并建立索引的bam文件后,可以使用多种工具例如bcftools、gatk、freebayes、lumpy、delly、varscan2等处理得到。

处理vcf格式文件的软件有许多种,包括:bcftools、vcftools、gatk、python_pyvcf、plink等。

———以上属个人理解与记录

到此,以上就是中国AI网小编对于vcf是什么文件的问题就介绍到这了,希望介绍关于vcf是什么文件的5点解答对大家有用,有所帮助!